古神翼龙在孤岛地图分布广泛但数量稀少，整个地图通常只有三到五只活动。它们主要出现在红色方尖碑附近区域，平原、开阔树林和空地也有机会遇到。这类生物警觉性极高且总在高空盘旋，靠近时一定要保持隐蔽，穿上吉利服能大幅降低被发现概率。追踪时需要借助工具辅助，用望远镜持续观察天空，锁定目标后立即骑乘无齿翼龙或其他飞行坐骑跟上，注意保持距离避免惊扰。预判其飞行路线很重要，可以尝试将目标引向狭窄山谷或密集树林。
已经驯服的生物也能协助，例如用翼龙分散注意力或阻挡逃跑路线。成功接近后驯服分三步操作，首先在十到十五米距离内快速甩出流星锤捆住目标，接着立刻用麻醉箭或麻醉镖射击，射击过程必须连续不能中断。也可以找在地上爬行的古神翼龙使用流星锤，但需要奔跑的同时丢出，古神翼龙被捆时间极短，动作稍慢就会挣脱逃离。
麻醉工具推荐携带麻醉箭二十支以上，麻醉镖准备十发左右更稳妥。射击时优先瞄准身体侧面，该部位命中率较高。击晕后需要立即投喂食物，最佳饲料是异特龙蛋饲料，没有的话用优质熟肉或优质生肉替代。喂食期间要持续添加麻醉药维持昏迷状态，建议使用水母毒素来喂食。驯服全程保持安静，附近有肉食恐龙活动要及时清除。
驯服后的古神翼龙能搭载三人，飞行耐力远超无齿翼龙，长途移动时优势明显。其特殊能力是攀附岩壁和树木，遇到危险可以紧急吸附在垂直面上躲避。安装泰克鞍具后能发射离子炮，这对小型生物有显著杀伤力。另外它还能抓起美颌龙等小型生物，协助驯服其他恐龙。
